4D-DIA定量蛋白质组学
- 公司名称 武汉傲星生物科技有限公司
- 品牌 其他品牌
- 型号
- 产地
- 厂商性质 经销商
- 更新时间 2024/3/11 11:03:50
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实验介绍
4D-蛋白质组学是基于新一代 timsTOF Pro 质谱仪，通过捕集离子淌度（ TIMS ）与同步累积连续碎裂（ PASEF ）扫描模式进行差异定量蛋白质组学研究。该技术核心是在传统 3D 分离（保留时间、质荷比、离子强度）基础上，增加肽段的碰撞截面积（ CCS ），实现第 4 维度（离子淌度）的分离检测。 4D-DIA 蛋白质组学是基于 timsTOF Pro 离子淌度平台的新一代 DIA 技术，通过数据非依赖采集 - 同步累积连续碎裂（ diaPASEF ）扫描模式进行差异定量蛋白质组学分析。将 DIA 技术与基于 timsTOF Pro 上的 diaPASEF 技术相结合，具有高扫描速度和高灵敏度优势的同时，外加第四维离子淌度分离，使 DIA 数据在采集时不牺牲窗口循环速度的同时，降低谱图复杂度和提高离子利用率，实现了蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。
实验流程：
应用方向
▶ 临床微量样本检测方式，如：外泌体、FFPE石蜡切片、活检穿刺组织等
▶ 临床大队列样本分析，如肿瘤、心血管等重大疾病精准分型
▶ 作物群体性状等大规模样本研究，如育种品系、胁迫干预等
▶ 临床生物标志物发现：DIA接近MRM的定量能力，实现标志物筛选与初步验证过程合二为一
▶ 生物样本信息库构建：DIA可实现生物信息的完整保存，为后续回溯分析提供保障。药物应答、基因敲除/过表达的蛋白表达谱分析
数据分析
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标准数据分析内容 |
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鉴定结果统计与分析 |
样本蛋白质及肽段鉴定柱状图、PCA分布图、定量差异统计分析 |
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生物信息学分析 |
GO及 GO 富集、 KEGG 及 KEGG 富集分析、 PPI 互作网络与 module 分析 |
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差异上下调蛋白KEGG蝴蝶图、 KEGG 通路功能归属等 |
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高级数据分析内容 |
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标志物筛选 |
集成机器学习、LASSO回归分析、标志物 panel 、 ROC 分析 |
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分子分型分析 |
无监督聚类分型分析、蛋白质组+转录组联合分析、激酶分析 |
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临床表征与组学结果联合分析 |
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疾病相关功能模块分析 |
WGCNA共表达分析 |
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生存曲线分析 |
临床分型与生存曲线分析 |
技术优势
▶ 4D技术加持，更加适合微量样本
▶ 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制，灵活方便
▶ 采用布鲁克的timsTOF Pro质谱平台，检测速度提升近一倍
采购中心
化工仪器网