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以DIG 标定核酸探针0

阅读:457          发布时间:2011-1-18

  DNA探针一般可以用32P, 35S或非放射性物质如biotin及digoxigenin (DIG) 加以标定;标定时利用DNA聚合酶的活性,在DNA聚合反应中,另加入 [α-32P] dATP,[α-32P] dCTP或DIG-11-dUTP等标定物质,所合成出來的即是被标定的核酸片段。目前常見的方法包括nick translation, random priming与polymerase chain reaction(PCR) 等。 若须对DNA进行end labeling时,可以进行kinase或filling-in reaction。

    前者以 [γ-32P] ATP为phosphate donor,利用T4 polynucleotide kinase的活性对带有5’-OH的DNA进行标定。人工合成的寡核苷酸 (oligonucleotides) 5’端为-OH group,可直接用于kinase reaction;一般DNA片段,若5’端带有phosphate group,先经phosphatase处理,再进行kinase reaction。 Filling-in reaction是将DNA以特定限制酶切开,露出recessed 3’ termini后,利用Klenow的活性把3’端补齐 (filling-in);因此,只要加入适当的 [α-32P] dNTP,即可在DNA的3’端进行标定。
    此外,也可以应用bacteriophage T4 DNA polymerase 的3’→5’ exonuclease 活性制造recessed 3’termini,再进行filling-in。 至于正意股或反意股RNA探针,则可以 [α-32P] UTP或DIG-11-UTP等为标定物质,应用胞外转录反应加以标定。 下面要介绍的是目前zui常用的方法:random priming及PCR。

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