脊椎动物免疫机构的原始型在昆虫中仍能被找到，但也并非。两者位于古生代分类系统树的二个分枝的顶点。在长期进化中，为了解决种族延续的共同课题，各自找到了不同的解决方法。在比较二者的免疫性时，必须区别它们是由于同样机构得到的相同免疫效果，还是机构不同而免疫机能相似。

    脊椎动物的免疫应答，能处理以胞饮作用进入细胞的抗原，抗原信息再传递到其他的淋巴系细胞（B细胞和T细胞），在多数情况下，引起免疫球蛋白的产生。脊椎动物寿命长，子孙数少，对免疫原有特异性免疫应答和免疫记忆。脊椎动物虽有非特异性的防御反应，但多数在特异性免疫反应面前被掩盖。

    昆虫对体内异物虽然产生吞噬作用或被囊化，但不产生免疫球蛋白。作为体液性免疫应答而产生的杀菌物质，缺少特异性，仅在短时间内保持活性。未发现免疫记忆现象，也没有相当于作为免疫记忆基础的淋巴组织。昆虫虫体小，寿命短，易受环境的直接影响，对侵入体内的寄生物，不具备脊椎动物那样的免疫机构，所以一旦发病，通常就难免死亡。即使如此，但由于昆虫生殖能力高，子孙数多，所以仍能进行种族衍续。昆虫的吞噬细胞，在形态上、生理上和哺乳动物的单核白细胞以及由其分化的组织中的巨噬细胞相类似。在没有血清的条件下，昆虫血细胞和巨噬细胞对异物识别的图象很相似。不过昆虫血细胞和巨噬细胞不同，它没有免疫球蛋白的受体，二者都是利用糖酵解作为吞噬作用的能源。同时，吞噬时细胞的呼吸强度并不增强。昆虫虽能识别体内的异物，但不能区别异物的微小差别。脊椎动物具有以淋巴细胞为基础的特异性识别机构，能识别异物和监视体内恶性化细胞，因为这些恶性化细胞具有与正常细胞不同的表面抗原，所以，通常作为异物被排除；偶尔不能排除时，即发生恶性肿瘤。在昆虫中缺乏这种以淋巴细胞为基础的特异性识别机构，也很少看到恶性肿瘤。

    在脊椎动物的免疫中，和抗体相并的补体系统担负着重要作用。昆虫体内则没有找到完整的补体系统，但有报道认为，某些现象可用存在一部分补体来解释。如用酵母多糖处理脊椎动物血清，则使血清缺乏补体C3～C9，不能发生溶细胞反应，若向该血清中加入蜚蠊或柞蚕的体液，则能引起免疫的细胞溶解。此外，在缺少二价金属离子的青蛙血清，因为C1～C2的反应不能进行，故没有细胞溶解能力，但向其中加入蜚蠊体液和眼镜蛇毒因子的复合体后，便具有细胞溶解能力。对绿脓杆菌具有获得性免疫的大蜡螟幼虫，注射眼镜蛇毒因子或酵母多糖后，免疫力即降低。这就似乎暗示昆虫体液中产生的杀菌物质，可能为与补体类似的物质