制氮机可用于制药工业的诸多加工环节中，从用于氮封高纯度制药原料到惰化吸塑包装和疫苗瓶。在制药环节中，为了避免氧化，需要减少氧气的存在，这时候就需要用到制氮机。用氮气氮封或惰化环境时，可以保持物质性质的稳定，否则与氧气接触会导致性质发生改变甚至产生毒性。氮气是一种干燥的惰性气体，当氧气会加速氧化或影响产品质量时，氮气就是替代氧气的一个非常好的选择。

转移
高压氮气也用于帮助物质从一个容器安全转移到另一个容器。这种的方法可以在不损害原有物质的同时有效加快转送过程

吹扫
生产和分析仪器可用氮气吹扫，以去除生产加工中的氧气或水分，提高产品质量并降低进一步需要加工处理的可能

氮封
化学性质活泼的药物成分和药品必须合理储存，以确保湿气和氧气不会影响产品品质，粉末不会结块。用氮气氮封可以提供一个惰化的环境，抑制空气造成的污染，如湿气滋生和细菌产生。氮气可以从根本上防止能与氧气发生反应的物质与氧气接触，并确保产品品质。

由于安全、方便、可靠同时也无需大量存储，氮气发生器也越来越广泛地应用于制药设备实验室或医院中，取代了高压气瓶。