(1)在线水质分析仪需要停用、拆除或者更换的，应当事先报经环境保护有关部门批准。运营单位发现故障或接到故障通知，应在24小时内赶到现场进行在线水质分析仪维修处理。
(2)对于一些容易诊断的故障，如电磁阀控制失灵、膜裂损、气路赌赛、数据仪死机等，可携带工具或者备件到现场进行针对性的维修。在线水质分析仪此类故障维修时间不应超过8小时。对不易诊断和维修的仪器故障，若72小时内无法排除，应安装备用仪器。
(3)在线水质分析仪经过维修后，在正常使用和运行之前应确保维修内容全部完成，性能通过检测程序，按国家有关技术规定对仪器进行校准检查。若监测仪器进行了更换，在正常使用和运行之前应对仪器进行一次校验和比对实验。
(4)若数据存储/控制仪发生故障，应在12小时内修复或更换，并保证在线水质分析仪已采集的数据不丢失。
(5)应备有足够的备品备件及备用仪器，对其使用情况进行定期清点，并根据实际需要进行增购，以不断调整和补充各种备品备件及备用仪器的存储数量。
(7)在线水质分析仪因故障不能采集、传输数据时，应及时向环境保护有关部门报告，必要时采用人工方法进行监测。在线水质分析仪人工监测的周期应不少于每2周一次。
