关键词:细菌16S rDNA菌种鉴定技术服务|实验技术服务
简介:世界*品牌细菌16S rDNA菌种鉴定技术服务|实验技术服务原装,质量保证,*。
细菌16S rDNA菌种鉴定技术服务|实验技术服务——pCzn1质粒+Arctic Express宿主菌低温表达体系。
我们具备丰富的蛋白表达设计经验及实验操作技巧,承诺客户不成功不收费。我们所有的实验数据真实可信,我们提供原始的表达菌株和克隆质粒,客户可以依据我们的实验报告重复我们的实验结果。
产品品牌: http://www.。。com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html
测序实验流程:
细菌16S rDNA菌种鉴定
16S rDAN是编码原核生物核糖体小亚基rRNA(16S rRNA)的基因。 长度约为1500pb,是细菌分类学研究中zui常用、zui有用的"分子钟16S rRNA其大小在1,500 bp左右,所代表的信息量适中,因此是进行分类研究的理想材料。利用16S rDNA两端的引物PCR扩增未知菌株的16S rRNA基因,并进行DNA测序,与GenBank中的已知序列进行同源性比较后,判定细菌种类,将细菌划分到属或种。
提供扩增细菌16S rRNA的全长序列,约1,500 bp,进行进行全序列测序,BLAST,以得到较为全面的种属特异性信息,确定样品的种类。
服务要求
1. 请提供基因组DNA、经菌种分离后带有单菌落的新鲜平板或斜面。
2. 基因组DNA的浓度≥10 ng/μl,总体积≥20 μl,且无明显降解;平板或斜面应长有分离的单菌落。
3. 由于革兰氏阳性细菌或厌氧菌、放线菌等特殊菌株,请在服务委托书中加以说明。
4. 如果测序结果出现如下套峰,视为样品不纯,本公司将收取全额实验费用。并建议克隆多个测序鉴定。
服务基本流程
1. 信诺金达进行引物设计合成;
2. PCR扩增16S rDNA;
3. PCR产物纯化;
4. 测序,序列比对分析。
服务报告内容
实验报告包括PCR产物照片、NCBI序列比对鉴定结果、测序报告、序列碱基图、以及剩余模板;
服务编号 服务项目 内容说明 价格 周期
SGSBD01 细菌16S rDNA菌种鉴定 16S rDNA全序列比对分析 ¥400/样品 1-2周*
SGSBD02 细菌16S rDNA菌种鉴定 16S rDNA全序列扩增,克隆测序,比对分析 ¥1000/样品 2周
*价格不含DNA提取费用,如果样品多或者特殊,时间协商。
技术特点
高通量:一次测序得到别以上条数的序列信息
高准确性:从几个到几十万个拷贝的计数
高分辨率:可以检测至单碱基差异
重复性好:深度测序保证了检测的随机性,可不需技术重复
成本低耗时短:相比于Sanger测序,价格及成本要低很多
生物信息学分析内容
标准信息分析
1. Reads拼接,获取Unique tags
2. OTU生成及统计分析
3. 物种注释及丰度统计
4. 样品OTU及物种丰度Heatmap图
5. Alpha多样性分析
6. Beta多样性分析
定制化信息分析
1. 样品差异主要因子分析
2. 样品间主坐标分析(PCoA)
3. 样品非加权配对平均法聚类分析(UPGMA)
4. 组间显著性差异分析
5. 系统进化树构建
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