与普通PCR模式相比，实时荧光PCR具备几个方面的优势：

 1、由于实时荧光PCR采用封闭的检测模式，因此扩增产物导致污染的可能性比普通PCR要小得多。

2、由于扩增产物的检测在PCR扩增过程中同时进行，并且数据的采集、分析全部由仪器自动完成，因此整个检测所需的时间比普通PCR要节省许多。
3、实时荧光PCR检测模式功能强大，具备定性、定量、突变、多项目等检测功能。而普通PCR要完成上述项目需采用不同的技术平台。
4、实时荧光PCR进行定量检测时，其定量线性范围（5-6 logs）比普通PCR（2-3 logs）要宽得多。
   随着反应试剂、仪器和操作的不断发展和完善，以实时荧光PCR技术为核心的检测试剂盒纷纷问世，逐步趋向于灵敏特异、快速精确和自动化。