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单细胞转录组是一项新开发的技术
阅读：692 发布时间：2021-9-22
单细胞转录组的技术在目前的科研实验中应用越来越多。最初的细胞转录组我们都是把一群细胞或一个器官混合到一起去提取RNA，获得的是每个细胞中RNA表达量的平均值，单细胞是把每个细胞单独分出来去提取RNA，然后建库测序，获得是是单个细胞的表达值。在每个细胞里面基因的表达具有随机性，且存在异质性。
细胞群中会存在不同类型的细胞，尤其是当我们对整个组织或者器官进行测序时，它们本身就是由不同类型的细胞组成的，而我们用普通转录组来测序，相当于掩盖住了这些不同的细胞类型的差异，展示的是整个组织的平均的状态，所以说单细胞从这个来看跟普通转录组就不同在是用一个细胞测，不是用一堆细胞测。
单细胞的RNA量比较少，所以要扩增的话循环数就会比较多，会引入一些PCR扩增带来的偏好性，为了解决这个问题，就有了现在的技术—体外转录，这个技术不通过扩增，在RNA上加一个T7的启动子，让它一轮一轮的转录出新的RNA，实现线性扩增。
单细胞转录组测序主要应用于特别难获取的细胞，比如说胚胎发育早期，合子，二细胞，四细胞，八细胞期，这时候因为每一个阶段细胞的数目都是很有限的，当时就想着能够开发一个技术对这种含量特别少的细胞能够提取建库成功，然后获得它们的表达量，从而来研究这些常规转录组所研究不了的生物过程，所以当时的发展是尽量提高测序的深度。
转录组可用于多种物种的组织，包括小鼠脑和人乳腺癌组织、人心脏组织和拟南芥花序组织，是一项新开发的技术，已显示可用于小鼠大脑的冷冻切片分析。这些直接的mRNA捕获方法不需要其他的设备，具有相对简单的分析方法，并且可能大规模应用于许多组织。
Namocell单细胞分离仪可以快速、高效、轻柔地帮助用户将目的单细胞分离至8联排，96孔板或者384孔板中，用于后续的单细胞转录组检测。对于用户的特殊细胞样本如少量细胞、极低阳性含量的稀有细胞等，Namocell都可以提供更好的解决方案，为用户提供更好的单细胞。
上图显示的是相同细胞样本通过FACS流式分选和Namocell的Hana单细胞分离仪分选得到的单细胞，分别进行单细胞测序得到的结果。可以清楚地看到，通过Hana分离后的单细胞状态更好，能够有更多有用的信息被检测到。