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了解单细胞RNA，从这里开始！
阅读：239 发布时间：2023-3-9
单细胞测序可以分为单细胞DNA测序和单细胞RNA测序，细胞是生命活动的基本单位，1个细胞中含有的RNA只有1-10pg，这么少的量远远达不到现有测序仪的zui低上样需求，因此对于单细胞RNA测序，首先要解决的问题是RNA扩增。
1990年，NormanIscove课题组，使用PCR技术实现了对cDNA分子的指数级扩增，初次证实对单细胞进行转录组分析是可行的。
20世纪90年代初期，Eberwine等人发明了一种新技术，能够从单个活神经元细胞中获得cDNA，并且再以这些cDNA为模板转录生成RNA，实现RNA的线性扩增。
2008年发展出了高通量RNA测序技术（二代测序），随后科研人员将高通量测序技术与之前发展起来的核酸扩增技术结合起来，对单细胞转录组进行了更加精细的研究。早期出现的单细胞RNA扩增方法结合二代测序方出现在2009年，即Tang’smethod。
Tang通过对单个小鼠卵裂细胞的研究发现，与芯片技术相比，利用单细胞转录组技术可以多发现数千个基因的表达情况。之后，许多新颖的技术被开发出来，可以更快速、低成本地提供更多信息。
Quartz-Seq实际上是对Tang的方法进行了优化，简化了实验流程，进一步减少了扩增副产物的产生。CEL-seq技术于2012年发表在《CellReports》上，由以色列理工学院的研究人员开发，CEL-seq是用体外转录代替PCR达到扩增的目的。2014年《Science》杂志发布的MARS-seq与CEL-seq很类似。Smart-Seq是一项具里程碑意义的技术，2012年由美国和瑞典的科学家共同开发。
Smart-Seq和Smart-Seq2是基于SMART技术（SwitchingMechanismat5′EndofRNATemplate）对目标RNA进行扩增、测序，而且已经有了较为成熟的商品化试剂盒，是目前应用较多的手段。