光化学反应仪使用深紫外的光源主要应用于研究分子吸收光能后发生化学反应的实验。

在光化学反应中，分子吸收光能后，会从基态跃迁到激发态，激发态的分子不稳定，会通过释放能量回到基态，同时释放出荧光或化学反应的能量。

深紫外的光源具有较高的能量，可以激发分子发生化学反应。此外，深紫外的光源还可以用于研究高温高压条件下，分子吸收光能后发生化学反应的实验。

因此，光化学反应仪使用深紫外的光源主要用于研究分子吸收光能后发生化学反应的实验。