薄层色谱成像系统是近年来发展起来的一种微量、快速而简单的色谱法，它兼备了柱色谱和纸色谱的优点。一方面适用于小量样品(几到几十微克，甚至0.01μg)的分离；另一方面若在制作薄层板时，把吸附层加厚，将样品点成一条线，则可分离多达500mg的样品。因此又可用来精制样品。待点样、展开后，与适宜的对照物按同法所得的色谱图作对比，用以进行药品的鉴别、杂质检查或含量测定的方法。
相比气相色谱和液相色谱，薄层色谱具有其好的优势，这决定了它在色谱赛道上是不可少的，未来也是充满光明的。
首先，薄层色谱所提供的彩色图谱，显色清晰，结果直观。相比于其他抽象的轮廓图，观察者肉眼便可识别检测结果，简单易懂。
其次，薄层色谱是开放型色谱，它的固定相任选、流动相任选、衍生试剂可以任意选择，试剂消耗量低，并且都是一次性使用，防交叉污染。这不仅可以实现多样品的平行检测，还极大的简化样品前处理过程，尤其适用于复杂成分样品的快速检测。
随着研究应用多样化的需求，多种检测技术手段的联用也越来越多。而薄层色谱技术的开放型色谱属性可以实现与各种其他检测手段的联用，例如TLC-MS、TLC-LC(DAD)-MS、TLC-NMR、TLC-FTIR等，因为样品前期已经经过薄层的初次分离，使后续目标化合物的进一步特征性检测就变得更加简单且灵敏。
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